Суббота началась с желания подготовить лекцию для студентов, но вылилась в очередной холиварный лонгрид:)
Недавно мне напомнили про одну статью, написанную в 2019 году по теме «Как мы айтишники, вас, биологов и медиков научим работать» (Ссылка). Статья безусловно заслуживает внимания, написана профессионалом своего дела приятным и живым языком. Ниже я приведу несколько замечаний по тексту статьи, а в конце некоторые мои мысли по теме.
1. «У тайного ордена задача — не создать новое знание, не приумножить старое, а просто сохранить знания древних. Из-за этого медицина многие годы тормозила.»
- Тут сложно согласиться. Мы вынуждены тормозить, так как слишком велико влияние ошибки. Это могут быть и сотни, и десятки тысяч жизней (а может и сотни тысяч – мир глобален, из-за этого воздействие может носить сейчас более массовый характер, чем 40 лет назад). Самый известный пример, история с талидомидом (Ссылка).
2. Весь разговор про использование методов программирования в медицине очень хорош, до момента начала работы на животных или на людях. Клетки, ткани, физ-химия и прочее, но не люди.
3/ «Я могу сказать, что я знаю как минимум один препарат, который три года назад начался с пулл-реквеста и который сейчас получает сертификацию FDA.»
- Очень бы хотелось услышать название препарата, прошло уже 6 лет, но я не смог найти в интернете историю про препарат, где от идеи до одобрения FDA всего 4 года. Есть конечно отдельная тема с Breakthrough Therapy Designation Approvals, но опять же, от идеи до одобрения…. (Желающие могут в ручная проверить по этой ссылке) Если убрать времена COVID-19 никому не удалость только все стадии клинических исследований провести за 3 года, я молчу про доклинические исследования, так что это звучит как «купите нашу программу, а еще мы в консалтинг могем!

4. Я не смог найти данные ВОЗ о точности только 24% диагнозов.
5. «Это переход от закрытой разработки, как это было принято многие годы в рамках небольших научных коллективов, открытым процедурам. Я уверен, что пройдет года 3-4, и вы увидите маленькие исследовательские лаборатории, которые все держат на Гитхабе и которые готовы принимать пулл-реквесты от людей снаружи».
- Этого не произошло и не произойдет еще очень долго. Фарма – это про большие деньги, даже когда мы готовим про биотех стартапы. И никто в здравом уме не будет выкладывать перспективные разработки в доступ. К сожалению, в науке примерно такая же ситуация, грантовая система + публикации в ТОПвых журналах создают конкуренцию, которая порождает воровство идей и данных. Как абстрактная идеалистическая идея – изумительная! Но как это включить в суровую капиталистическую реальность?
Рассказ про распределенные эксперименты в биологии заслуживает внимания. Это было бы великолепно! Если бы не с десяток «но». Когда ты работаешь с клетками то для однородности данных нужны одинаковые линии и желательно имеющие близкие пассажи, так как клетки меняются. Когда переходишь на крыс, там начинается просто кошмар, который мы не можем преодолеть толком. Это и разные линии животных, состояние вивария, время года, период полового цикла, и так дале… С людьми все еще сложнее, именно поэтому клинические исследования такие большие, сложные и дорогие.
А теперь несколько слов во славу ITв медицине и фарм разработке.
- Внедрение методов биоинформатики, моделирования 3D структур и т.д. сильно ускорили и удешевили разработку и исследование новых препаратов. Но это началось уже лет 25 назад, сейчас это уже норма жизни.
- Применение машинного обучения и модного сейчас искусственного интеллекта к обработке различных снимков и лабораторных анализов показывает свою эффективность и будет в ближайшем будущем внедрено в повседневную практику.
- Real world data/Real world evidence – это даже не будущее, это уже наше настоящее. И безусловно, big data вносит здесь ключевой вклад. Направление динамично развивается и позволяет корректировать наши знания о течении заболеваний, реальной (с большими оговорками) практике использования препаратов, межлекарственного взаимодействия и т.д. Но нельзя сказать, что (по крайней мере пока) RWD/RWE может заменить клинические или доклинические исследования. Все-таки там каждая буква написана кровью.
- Говорить про массовое внедрение AI в разработку препаратов пока не приходится. Мы что-то пробуем, что-то проверяем, но пока рано. Медицина и фармацевтика, к счастью, консервативные отрасли.
В целом за последние несколько лет не раз приходилось сталкиваться с «небожительством» представителей IT индустрии, которые считают представителей не IT отрасли людьми второго сорта. Не буду судить – тут у каждого свое мнение, я же просто буду продолжать заниматься тем, что умею: исследовать новые лекарства и учить новые поколения исследователей. В целом потребность в междисциплинарной коммуникации нарастает от года к году, как и потребность в таких специалистах. Но это сложно…. Такие люди должны понимать языки, на которых говорят представители разных направлений и выступать переводчиками. Это требует как теоретической, так и практический подготовки, и таких людей всегда катастрофически мало. В статье выше мы как раз и видим пример человека, который претендует на такого междисциплинарного коннектора, но при этом достаточно однобокого. Наладить коммуникации, понять потребности, придумать как соединить практики разных направлений – да! А вот залетать с 2 ног, что медицина — это не наука – это путь не туда.
На самом деле, попытки воспитать таких междисциплинарников делаются уже давно. Первая попытка, по крайней мере в России, вырастить «универсальных бойцов» в плане скрещивания биологии, математики и IT, была предпринята в МГУ в 2002 году, когда был основан факультет биоинженерии и биоинформатики. Это было очень интересно и очень непросто, и первые выпуски расслоились на «мокрых биологов» и биоинформатиков. Но мы всегда могли поговорить между собой на одном языке, понимая сложность разных направлений и при этом не принижая их важности.