Не паникуйте, все у Вас нормально, проблемы с прогой и данными брокера в ней не Ваши проблемы. Письма Минфина или ФНС по вычету в топку, только налоговый кодекс, вывод средств с ИИС это момент его закрытия. Наймите адвоката или аудиторскую контору, но сначала напишите в УФНС региона, а лучше сходите на приём в управление в отдел ндфл кто курирует.