Инвестор, цитирую

налоговый вычет не применяется при реализации (погашении) ценных бумаг, если эти ценные бумаги были учтены на индивидуальном инвестиционном счете налогоплательщика на дату их реализации (погашения) и (или) ранее этой даты.

astray, отвечу так, надеюсь будет понятно )

если у вас у одного брокера открыт ИИС и обычный брокерский счет, то по итогам года при расчете НДФЛ брокер учтет выплаты дивидендов по незакрытым ИИС и брокерским счетам, а также доходы по сделкам с ценными бумагами и пфи плюс купоны на брокерском счете.

astray, конечно на ИИС брокер удержит налог по сделакам при закрытии счета, если на старом счете вы воспользовались вычетом по типу А. 

В вашем первом вопросе не было уточнения, что прибыль вы считаете на открытом ИИС. Согласно НК РФ налог на ИИС удерживается в момент выплаты дивидендов и при закрытии счета.