Evtu, берем во внимание только официальные ответы ФНС, т.е. на бумаге. Отказ по телефону еще не является отказом в вычете

Evtu, ответили вам. Все пустые неиспользуемые ИИС, как только узнали о них, нужно закрывать

Evtu, если вы не получали вычет со взносов ни по одному счету, то возвращать налоговой вам нечего. Налог по сделкам по ИИС исчисляют после закрытия счета. По дивидендам налог удерживают сразу. Про пени Geksor вам все правильно написал. Если вычет со взносов вы не получали, то можно попробовать через подачу декларации, т.е. сначала брокер удерживает налог, а после успешной проверки в фнс вы его возвращаете. Счет в Атоне должен быть закрытым

Evtu, Если не помните, то может лучше вспомнить или разбираться с Атоном, почему и как так получилось что счет открыт, а вы не помните?

Возможно автоматом была проставлена галочка при открытии счета или вклада открыть ИИС, а вы не заметили? Но в этом случае то кто виноват? галочка, бумажка или все же вы, что не внимательно читаете что подписываете/открываете?

Evtu,
«Т.е. по факту сейчас ситуация, что чем дольше я не закрываю ИИС, тем больше налогов и пеней мне придется платить»

Вы откуда взяли этот бред? :)
У Вас нет налога, а равно и «пеней» с этих налогов, пока не закрыт иис. И налог появляется, только после закрытия иис и только в этом году(периоде). В этом, собственно принцип действия иис. Иногда полезно изучать матчасть.

Evtu, 

Людей в кабалу загонять?

Загонять? А кто забыл про открытый ИИС?
То что вы попали в эту ситуацию виноваты только вы, а не брокер или ФНС и за свои фейлы научитесь отвечать сами, а не скидывать вину на других.